آیین افتتاحیه حوزه علمیه شهید امام خامنه‌ای با شکوه خاص و با حضور حضرت آیت‌الله دکتر حیدری برگزار گردید. این مراسم معنوی، نقطه‌عطفی در آغاز فعالیت‌های آموزشی و تربیتی این مجموعه حوزوی به شمار می‌رود.
در این نشست، معظم‌له ضمن تبیین بایسته‌ها و رسالت‌های خطیر طلبگی، طلاب گرامی را به دو رکن اساسی «خودسازی» و «دفاع از کیان اسلام» فراخواندند و بر ضرورت اهتمام جدی به تهذیب نفس و آمادگی همه‌جانبه برای ایفای نقش مؤثر در پاسداری از ارزش‌های دینی تأکید نمودند.